O juiz não pode decretar a suspensão do curso da ação penal de ofício, apenas mediante requerimento expresso e com a concordância de ambas as partes, tanto da defesa quanto do Ministério Público. 

Constitui característica/elemento das questões prejudiciais, de acordo com classificação doutrinária, a autonomia. Por essa característica, existiria um processo em que se tem a questão prejudicada e outro (autônomo e distinto) no qual se definiria a questão prejudicial. 

As questões prejudiciais são aquelas que tratam de temas de direito processual, não possuindo autonomia e independência, só podendo ser apreciadas pelo juízo penal.

As questões preliminares, que tratam de direito material, podem ser analisadas tanto pelo juízo penal quanto pelo extrapenal.

A questão prejudicial imperfeita é aquela que pertence a outro ramo de direito da questão prejudicada.